Společnost byla založená roku 1860 Edouardem Heuerem v St-Imier ve Švýcarsku. Už o devět let později si nechal potvrdit svůj první patent, který spočíval v natahování kapesních hodinek pomocí korunky. Další významný patent přišel v roce 1887, kdy si nechal patentovat oscilační pastorek pro mechanické chronografy, který se používá až do dnešních dob. První úspěchy zaznamenal Heuer stříbrnou medailí na mezinárodním veletrhu v Amsterdamu (1883). Další získal o 6 let později v Paříži. Na začátku 20. století se firma začala věnovat i přesným chronografům, patentovala si Pulsmetr (1908), který se používá do teď. Dále se chronografy montovaly do přístrojových desek aut (1911) a hlavně vydala „mikrograf“ s přesností 1/100 sekundy (1916). V chronografech firma pokračovala úspěšně a třikrát za sebou se s nimi prosadila i ve sportu jako dodavatel pro olympijské hry (Antverpy 1920, Paříž 1924, Amsterdam 1928). Spojením leteckého a automobilového světa vzniká v roce 1933 řada Autavia (z anglických slov AUTomobile a AVIAtion). Těmito úspěchy si firma vybudovala jméno v chronografech a od 50. let i u automobilistů. Potvrdila to legendárními řadami modelů Carrera (1963) a Monaco, které vznikli ve spolupráci se Stevem McQueenem (řadu vyznačuje její typický čtvercový tvar). V roce 1969 vydává svůj první chronograf s automatickým nátahem (kalibr 11), dále prohlubuje spolupráci se sportovci a stává se jednou z ikon časoměřičů pro sport. Roku 1985 se spojí v firmou TAG a o 14 let později spadá pod konsorcium LVMH. Dnes jeho kolekce čítá modelové řady Heritage (Autavia), Carrera, Aquaracer, Monaco, Formula 1 a Link.
